Bioinformática@Brasil

Meu tcc :-)

A medida que a Bioinformática avança, um número ainda maior de informações biológicas são incorporadas às análises, assim como novos algoritmos são utilizados, necessitando assim, de cada vez mais poder computacional para realização das análises dentro de um tempo hábil. Uma das maneira de contornar tal gargalo é a utilização da computação distribuída, que visa distribuir processos entre diversas máquinas, dessa maneira diminuindo seu tempo de execução.

O tutorial abaixo trata da instalação do LAM-MPI em ambientes Linux. Façam bom proveito :)

Livro com referência completa do padrão MPI.
Este livro é disponibilidade publicamente aqui.
O único problema é que cobre a versão 1.1 do MPI e não a última 2.0.

Para quem não tem um leitor postscript, coloquei em anexo uma versão em pdf que eu converti.

Tese de metrado do Yura Carvalho Ferreira na qual apresenta estratégias para paralelizar as pesquisas do mpiBLAST.

Meus objetivos aqui são:

1. Colocar todos os papers que eu tenho e cataloga-los e ter um breve resumo.
2. Por uma lista dos projetos em execução, por exemplo o workflow do douglas e meu tcc.
3. Links para projetos interessantes.
4. How-to: mpiblast

Será bom se todos participassem. Incluindo conteúdo e sua participação!
Alias, o firewall esta funcionando perfeitamente e está ativo!

Se não gostaram, por favor, nao briguem comigo!
Falo, que agora vou dormir... enquanto isso deixo o workflow rodando aqui em casa para ver se esta funcionando ben!